依據國民法官法第6條之規定，即使符合法律要件應行國民法官程序，法院在有下列情形時，仍可裁定不進行國民法官程序，而回歸原有之審判程序。
一、發動方式
（一）法院得依職權或當事人、辯護人、輔佐人之聲請，於聽取當事人、辯護人、輔佐人之意見後，裁定不行國民參與審判程序。
（二）若於國民法官法庭組成後欲為此裁定，法院應聽取國民法官、備位國民法官之意見。
二、法院可裁定不行國民法官程序之具體情形
（一）有事實足認行國民參與審判有難期公正之虞。
（二）對於國民法官、備位國民法官本人或其配偶、8親等內血親、5親等內姻親或家長、家屬之生命、身體、自由、名譽、財產有致生危害之虞。
（三）案件情節繁雜或需高度專業知識，非經長久時日顯難完成審判。
（四）被告就被訴事實為有罪之陳述，經審判長告知被告通常審判程序之旨，且依案件情節，認不行國民參與審判為適當。
（五）其他有事實足認行國民參與審判顯不適當。
三、模擬法庭活動與之後正式施行後的觀察
被告或辯護人在進行模擬法庭活動時，經常會以案件為社會矚目案件，犯罪情節已經媒體廣泛報導，可預見之後組成的國民法官法庭會受媒體報導內容影響，難以期待可公正行使職權為由，聲請裁定不行國民法官程序。
於111年進行案件演練模擬時，因模擬案件之需求，不可能為此裁定，所以法院就此聲請均裁定駁回。惟實際上考量到臺灣媒體現對於重大矚目案件之密集報導程度，被告之行為往往已經經過媒體報導或是有其他未經詳細查證之流言，則國民法官法正式上路後，職業法官是否會以此為由將案件裁定不行國民法官程序，值得進一步再為觀察。