國民法官法做為112年正式施行的新型法庭制度，其進行之程序及方式均有別於傳統的訴訟程序，在法規的規定上都有很多不同於傳統刑事訴訟審判程序的地方。
一、審判者
（一）國民法官新制：6位國民法官及3位職業法官組成國民法官法庭。
（二）通常訴訟程序：除獨任案件外，由3位職業法官組成合議庭。
二、起訴方式
（一）國民法官新制：卷證不併送，起訴時僅將起訴書送至法院，且起訴書中不得記載使法院就案件產生預斷之虞之內容。
（二）通常訴訟程序：卷證併送，起訴時會將全部卷證及起訴書送至法院。
三、被告如何獲知卷證內容
（一）國民法官新制：由檢察官對被告及辯護人為證據開示。
（二）通常訴訟程序：被告或辯護人向法院聲請閱卷。
四、有罪及死刑判決門檻
（一）國民法官新制：包含國民法官及法官雙方意見在內，達3分之2以上之同意始得判決有罪或為死刑判決。
（二）通常訴訟程序：過半數決定。
五、證據調查
（一）國民法官新制：當事人即檢察官、被告及辯護人自主出證。
（二）通常訴訟程序：改良式當事人進行主義。
六、審理模式
（一）國民法官新制：連日開庭、集中審理、即時評議、立即宣判。
（二）通常訴訟程序：依法官自行安排期日，再為宣判。